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百日咳菌の感染によって、特有のけいれん性の激しい咳発作を特徴とする急性の気道感染症です。
母親からの免疫（経胎盤移行抗体）が十分でなく、乳児期早期から罹患する可能性があり、1歳以下の乳児、特に生後6 カ月以下では死に至る危険性も高くなります。
感染者の咳やくしゃみなどの飛沫による感染（飛沫感染）や、感染者と接触したりすることによる感染（接触感染）とされています。
経過は3期に分けられ、全経過で約2～3カ月で回復するとされています。
１）カタル期（約２週間持続）
かぜ症状で始まり、次第に咳の回数が増えて程度も激しくなります。
２）痙咳期 （カタル期の後に約２～３週間持続）
次第に特徴ある発作性けいれん性の咳（痙咳）となります。
夜間の発作が多いですが、年齢が小さいほど症状は多様で、乳児期早期では特徴的な咳がなく、単に息を止めているような無呼吸発作からチアノーゼ（顔色や唇の色や爪の色が紫色に見えること）、けいれん、呼吸停止と進展することがあります。
合併症としては肺炎や脳症などもあり特に乳児では注意が必要です。
３）回復期
激しい発作は次第に減衰し、2～3週間で認められなくなります。
成人の百日咳では咳が長期にわたって持続しますが、典型的な発作性の咳を示すことはなく、やがて回復に向かいます。
全経過で約２～３カ月で回復します。
生後6カ月以上は、抗菌薬による治療が検討されます。また、咳が激しい場合には咳止め等の対症療法が行われることがあります。
百日咳の予防には、５種混合ワクチン（DPT-IPV-Hib）、４種混合ワクチン（DPT-IPV）、３種混合ワクチン（DPT）等の接種が有効です。定期予防接種の対象となっていますが、接種スケジュールはワクチンの種類によって異なります。
接種スケジュールについてはこちらをご覧いただくか、お住いの市町村へお問い合わせください。
「百日咳」は、全数把握対象（5類感染症の一部）であり、診断した医師は7日以内に最寄りの保健所に届け出なければならない。
届出基準はこちら
特有の咳が消失するまで、または、５日間の適切な抗菌薬療法が終了するまでは出席停止とされています。
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